生物有機(jī)肥在改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)方面發(fā)揮著不可替代的作用，但目前生產(chǎn)和銷售還存在一定困難，這是因?yàn)閷Φ霓r(nóng)產(chǎn)品并沒有完全做到優(yōu)價(jià)，在一定程度上影響了種植戶的積極性，使得生物有機(jī)肥的推廣遇到了較大困難。

近年來，生物有機(jī)肥在一些生態(tài)示范區(qū)、綠色和有機(jī)農(nóng)產(chǎn)品基地得到了較為廣泛的應(yīng)用，這是生物有機(jī)肥今后發(fā)展的主要方向。隨著綠色有機(jī)農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)規(guī)模的擴(kuò)大和人們消費(fèi)水平的提高，生物有機(jī)肥的生產(chǎn)應(yīng)用必是主流。

作物施用生物有機(jī)肥后， 其中的發(fā)酵菌和功能菌大量繁殖， 對改良土壤、促進(jìn)作物生長、減輕作物病害具有顯著效果。主要原因在于：一、肥料中的有益微生物會(huì)在土壤中大量定殖形成優(yōu)勢種群， 抑制其他有害微生物的生長繁殖，甚至對部分病原微生物產(chǎn)生拮抗作用，以減少其侵染作物根際的機(jī)會(huì)。

二、功能菌發(fā)揮功效增進(jìn)土壤肥力，比如施用含固氮微生物的肥料，可以增加土壤中的氮素來源；施用含解磷、解鉀微生物的肥料，其中的微生物可以將土壤中難溶的磷、鉀分解出來，以便作物吸收利用。

三、肥料中的許多微生物菌在生長繁殖過程中會(huì)產(chǎn)生對作物有益的代謝產(chǎn)物，能夠刺激作物生長，增強(qiáng)作物的抗病抗逆能力。

現(xiàn)階段， 國內(nèi)種植戶施用生物有機(jī)肥的積極性不高，生物有機(jī)肥使用率相對較低，主要在蔬菜、水果、中草藥、煙和草等附加值較高的經(jīng)濟(jì)作物上應(yīng)用。但隨著人們消費(fèi)水平和安全意識(shí)的提高， 對綠色有機(jī)農(nóng)產(chǎn)品的需求日益增強(qiáng)， 生物有機(jī)肥將會(huì)成為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的必然選擇。

目前，生物有機(jī)肥在一些生態(tài)示范區(qū)、綠色和有機(jī)農(nóng)產(chǎn)品基地應(yīng)用取得了較好的效果， 這對生物有機(jī)肥今后的推廣應(yīng)用起到良好的示范作用。