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PCR標本制備區(qū)
該區(qū)域主要進行的操作為樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應(yīng)管和測定DNA的合成。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應(yīng)避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動。
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pcr實驗室建設(shè)中應(yīng)該怎樣設(shè)置凈化水系統(tǒng)?
1.PROFIBUS-DP智能節(jié)點(硬件)實現(xiàn)
現(xiàn)場部分是恒壓供水箱液位、壓力和飲水箱溫度的測量裝置。在聚合酶鏈反應(yīng)實驗室的凈化過程中,各種測量儀器將采樣數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成4 ~ 20 mA的電流信號,然后通過可編程控制器獲得模擬輸入輸出模塊SM334,通過模擬/數(shù)字轉(zhuǎn)化獲得數(shù)字量0 ~ 27648;開關(guān)量輸入輸出與可編程控制器的數(shù)字量輸入輸出模塊相連。
2.控制單元
作為現(xiàn)場總線的主站,可編程控制器的處理器是314C-2DP,集成了輸入輸出通道。在pcr實驗室建設(shè)的凈化中,它通過自己的PRO-FIBUS-DP接口與從站相連。主站通信模塊為Len,用于PLC主站以工業(yè)以太網(wǎng)的形式與監(jiān)控計算機進行通信,速率為10 ~ 100 Mbit/s
3.上位機
上位機起監(jiān)控作用,采用西門子WinCC監(jiān)控組態(tài)軟件,提供圖形顯示、控制和報警畫面、實時和歷史趨勢曲線、歸檔和報表打印等功能模塊,適用于工業(yè)生產(chǎn)過程;此外,在聚合酶鏈反應(yīng)實驗室純化的WinCC還可以選擇系統(tǒng)診斷的SIMATIC可編程控制器,這為硬件維護提供了方便。
污染的預(yù)防與控制
PCR實驗室設(shè)計的核心問題是如何避免污染。常見的有以下幾種污染類型:擴增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。要避免污染,首先應(yīng)是預(yù)防,而不是排除。
標準的PCR實驗區(qū)
試劑準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)、各區(qū)配套的緩沖區(qū)及公共走廊。臨床基因擴增檢驗實驗室設(shè)計的核心問題是如何避免污染。
空氣流向:PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求,但是為了避免各個實驗區(qū)域間交叉gan染的可能性,通風(fēng)方式應(yīng)為機械通風(fēng),不應(yīng)自然通風(fēng),且不宜使用循環(huán)風(fēng)。同時要嚴格控制送、排風(fēng)比例以保證各試驗區(qū)的壓力要求。
PCR實驗室的空氣流向應(yīng)按照試劑儲存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)進行,防止擴增的產(chǎn)物順空氣氣流進入擴增前的區(qū)域。可選擇負壓排風(fēng)裝置,核心區(qū)域相對于相鄰區(qū)域小壓不小于-10Pa。也可通過安裝排氣扇或者其他方式實現(xiàn)。PCR實驗室要求溫度18~26℃,相對濕度30%~70%。