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等溫核酸試劑盒
試劑盒使用示例
試劑盒的產(chǎn)生正是為了使實驗人員能夠擺脫繁重的試劑配制及優(yōu)化過程,所以試劑盒中一般配備有相應(yīng)的使用說明書,用戶按照說明書不需或只需少量的優(yōu)化即可得到滿意的結(jié)果。
⑴試劑盒使用說明書
說明書一般包括公司標(biāo)志及名稱、試劑盒名稱、試劑盒組成、保質(zhì)期、使用領(lǐng)域、使用方法等項目
①一般在頁眉頁腳處為公司的名稱及標(biāo)志;
②接下來為試劑盒的名稱;
③試劑盒組成中應(yīng)為試劑盒中的所有內(nèi)容,為了簡潔明了,一般以表格的形式表現(xiàn);
④操作步驟是試劑盒說明書中很重要的部分,內(nèi)容應(yīng)準(zhǔn)確、簡潔、易懂,不能包含帶有歧義的句子,更不能含糊其辭,排版上操作步驟應(yīng)將復(fù)雜的步驟拆解,使人一目了然。
核酸試劑盒是如何工作的?
病毒獨特的基因序列被設(shè)定為檢測靶點,通過對檢測樣本進行PCR擴增,因PCR反應(yīng)模板僅為DNA,因此在進行PCR反應(yīng)前,應(yīng)將新型冠狀病毒核酸(RNA)逆轉(zhuǎn)錄為DNA,使靶點的DNA序列指數(shù)級增加,每一個擴增出來的DNA序列都可以于預(yù)先加入的熒光標(biāo)記探針結(jié)合,產(chǎn)生熒光信號,擴增出來的靶點基因越多,累積的熒光信號就越強(就好比演唱會如果只有一個粉絲搖熒光棒很不顯眼,如果大家一起搖那就嗨了)。如果樣本中沒有該病毒,自然也就檢測不到熒光信號的增強了。
核酸試劑盒
RPA技術(shù)主要依賴于三種酶:能結(jié)合單鏈核酸(寡核苷酸引物)的重組酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)和鏈置換DNA聚合酶。這三種酶的混合物在常溫下也有活性,反應(yīng)溫度在37°C左右。
重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物,能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動DNA合成,對模板上的目標(biāo)區(qū)域進行指數(shù)式擴增。被替換的DNA鏈與SSB結(jié)合,防止進一步替換。在這個體系中,由兩個相對的引物起始一個合成事件。整個過程進行得非常快,一般可在十分鐘之內(nèi)獲得可檢出水平的擴增產(chǎn)物。RPA擴增的基礎(chǔ)體系(TwistAmp? Basic)含有DNA擴增所需的所有試劑,我們只要準(zhǔn)備好引物和模板就行。擴增結(jié)果可以通過凝膠電泳進行終點檢測,產(chǎn)物純化后可用于下游研究。
在這個基礎(chǔ)體系中添入不同的酶和探針,就可以實現(xiàn)多樣化的RPA應(yīng)用。舉例來說,TwistAmp? exo結(jié)合了exo探針技術(shù)和核酸外切酶III,能實現(xiàn)數(shù)據(jù)的實時讀取,就像熒光定量PCR一樣。不過反應(yīng)終點的擴增子總量有所減少,適合獲得強熒光信號進行動力學(xué)分析,不適合終點檢測(比如跑膠)。將exo探針技術(shù)、核酸外切酶III和逆轉(zhuǎn)錄酶結(jié)合起來,可以一步實現(xiàn)RNA模板的實時擴增。
RPA是什么?
自PCR技術(shù)誕生以來已經(jīng)有三十年了。從經(jīng)典PCR、實時定量PCR再到現(xiàn)在的數(shù)字PCR,這一技術(shù)在不斷蛻變卻從未淡出我們的視野。英國TwistDx Inc公司開發(fā)的重組酶聚合酶擴增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),被稱為是可以替代PCR的核酸檢測技術(shù)。以此為基礎(chǔ)的TwistAmp? 核酸擴增產(chǎn)品,能夠在15分鐘內(nèi)進行常溫下的單分子核酸檢測。該技術(shù)對硬件設(shè)備的要求很低,特別適合用于體外診斷、獸醫(yī)、食品安全、生物防御和農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。