生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體（如畜禽糞便、農(nóng)作物秸稈等）為來源并經(jīng)無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。生物有機肥對實現(xiàn)資源節(jié)約型、環(huán)境友好型社會具有重要意義，是實現(xiàn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的必然選擇。當前世界農(nóng)作物化肥施用量為120 kg/hm2， 中國農(nóng)作物化肥施用量為328.5 kg/hm2，遠高于世界平均水平。化肥過量施用、盲目施用帶來了成本的增加、環(huán)境的污染、土壤的退化等一系列問題。

土壤是一個國家很重要的自然資源。沈其榮認為土壤基礎(chǔ)地力是實現(xiàn)作物產(chǎn)量潛力的關(guān)鍵因素， 就每千克化肥在不同作物上的平均增產(chǎn)效果而言，1975 年為25 kg 谷粒/kg 化肥、15 kg 油料/kg 化肥、10 kg 棉花/kg 化肥；2008 年為8~9 kg 谷粒/kg化肥、6～7 kg 油料/kg 化肥、5～6 kg 棉花/kg 化肥?；蕡蟪甑募眲∠陆当砻?，隨著化肥的長期使用，土壤的基礎(chǔ)地力正在逐漸減弱， 而土壤基礎(chǔ)地力的減弱已成為影響中國農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和農(nóng)作物高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)的重要限制因素。

與農(nóng)家肥相比，生物有機肥的根本優(yōu)勢在于： 生物有機肥中的功能菌對提高土壤肥力、促進作物生長具有特定功效，而農(nóng)家肥屬自然發(fā)酵生成，不具備優(yōu)勢功能菌的特別的效。

與生物菌肥相比，生物有機肥包含功能菌和有機質(zhì)，有機質(zhì)除了能改良土壤，其本身就是功能菌生活的環(huán)境，施入土壤后功能菌容易定殖并發(fā)揮作用； 而生物菌肥只含有功能菌， 且其中的功能菌可能不適合有的土壤環(huán)境，無法存活或發(fā)揮作用。另一方面，生物有機肥比生物菌肥價格更為便宜。

 傳統(tǒng)的化肥相比，生物有機肥很好的處理了土壤問題，可以改進土壤和進步作物質(zhì)量。生物有機肥含有豐厚的有機質(zhì)和各種營養(yǎng)物質(zhì)，不只為植物生長提供營養(yǎng)，其豐厚的微生物，還可促進土壌團粒構(gòu)造構(gòu)成，改進主壤物理性狀，進步主壤保肥保水才能，是處理土壤問題的不二之選。微生物在生物有機肥中發(fā)揮宏大作用，那么，生物有機肥中的作為生物到底是些什么生物呢？