原位雜交技術(shù)基本原理
原位雜交技術(shù)的基本原理是利用核酸分子單鏈之間有互補的堿基序列,將有放6射性或非放6射性的外源核酸(即探針)與組織、細(xì)胞或染色體上待測DNA或RNA互補配對,結(jié)合成專一的核酸雜交分子,經(jīng)一定的檢測手段將待測核酸在組織、細(xì)胞或染色體上的位置顯示出來。
為顯示特定的核酸序列必須具備3個重要條件:組織、細(xì)胞或染色體的固定、具有能與特定片段互補的核苷酸序列(即探針)、有與探針結(jié)合的標(biāo)記物。
總的來說,隨探針濃度增加,雜交率也增加。另外,在較窄的范圍內(nèi),隨探針濃度增加,敏感性增加。依我們的經(jīng)驗,要獲得較滿意的敏感性,膜雜交中32P標(biāo)記探針與非放0射性標(biāo)記探針的用量分別為5~10 ng/ml和25~1000ng/ml,而原位雜交中,無論應(yīng)用何種標(biāo)記探針,其用量均為0.5~5.0μg/ml。探針的任何內(nèi)在物理特性均不影響其使用濃度,但受不同類型標(biāo)記物的固相支持物的非特異結(jié)合特性的影響。
根據(jù)不同的雜交實驗要求,應(yīng)選擇不同的核酸探針。在大多數(shù)情況下,可以選擇克0隆的DNA或cDNA雙鏈探針。但是在有些情況下,必須選用其它類型的探針如寡核苷酸探針和RNA探針。例如,在檢測靶序列上的單個堿基改變時應(yīng)選用寡核苷酸探針,在檢測單鏈靶序列時應(yīng)選用與其互補的DNA單鏈探針(通過克0隆人M13噬菌體DNA獲得)或RNA探針,寡核苷酸探針也可。長的雙鏈DNA探針特異性較強,適宜檢測復(fù)雜的靶核苷酸序列和病原體 ,但不適宜于組織原位雜交,因為它不易透過細(xì)胞膜進(jìn)入胞內(nèi)或核內(nèi)。在這種情況下,寡核苷酸探針和短的PCR標(biāo)記探針(80~150bp)具有較大的優(yōu)越性。