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發(fā)布時間:2020-12-10 11:49  






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熒光定量PCR樣品RNA的抽提①取凍存已裂解的細(xì)胞,室溫放置5分鐘使其完全溶解。②兩相分離 每1ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2ml的氯i仿,蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12000rpm離心15分鐘。在real-time技術(shù)的發(fā)展過程中,兩個重要的發(fā)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用:(1)在90年代早期,TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測PCR產(chǎn)物成為可能。離心后混合液體將分為下層的紅色酚氯i仿相,中間層以及無色水相上層。RNA全部被分配于水相中。水相上層的體積大約是勻漿時加入的TRIZOL試劑的60%。

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近年來,分子遺傳學(xué)診斷技術(shù)發(fā)展迅速,熒光定量PCR(QF-PCR)技術(shù)、熒光原位雜交(FISH)技術(shù)、多重連接探針擴(kuò)增(MLPA)技術(shù)、實(shí)時熒光PCR技術(shù)、染色體微陣列分析(CMA)技術(shù)、產(chǎn)前液相芯片(BoBs)技術(shù)、無創(chuàng)性產(chǎn)前基因檢測(NIPT)等已逐漸成熟,并開始向臨床轉(zhuǎn)化。我們的客戶對象是食品企業(yè)/公司/廠、食品加工企業(yè)/公司/廠、冷凍食品加工企業(yè)/公司/廠、養(yǎng)殖場、養(yǎng)豬場、屠宰場、生豬屠宰場。分子遺傳學(xué)診斷技術(shù)多以遺傳物質(zhì)DNA為檢測對象,不需要進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),為傳統(tǒng)的細(xì)胞染色體核型分析技術(shù)提供了有效的補(bǔ)充。


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一般而言,熒光擴(kuò)增曲線可以分成三個階段:熒光背景信號階段,熒光信號指數(shù)擴(kuò)增階段和平臺期。在熒光背景信號階段,擴(kuò)增的熒光信號被熒光背景信號所掩蓋, 無法判斷產(chǎn)物量的變化。常規(guī)PCR中,擴(kuò)增產(chǎn)物(擴(kuò)增子)是通過終點(diǎn)法來分析檢測,即PCR反應(yīng)結(jié)束后,DNA通過瓊脂糖凝膠電泳,然后進(jìn)行成像分析。而在平臺期,擴(kuò)增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級的增加,PCR 的終產(chǎn)物量與起始模板量之間沒有線性關(guān)系,根據(jù)終的 PCR 產(chǎn)物量也不能計(jì)算出起始 DNA 拷貝數(shù)。只有在熒光信號指數(shù)擴(kuò)增階段, PCR產(chǎn)物量的對數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系,我們可以選擇在這個階段進(jìn)行定量分析。為了定量和比較的方便,在實(shí)時熒光定量 PCR 技術(shù)中引入了兩個非常重要的概念:熒光閾值和 CT值.

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什么是熒光定量PCR?常規(guī)PCR中,擴(kuò)增產(chǎn)物(擴(kuò)增子)是通過終點(diǎn)法來分析檢測,即PCR反應(yīng)結(jié)束后,DNA通過瓊脂糖凝膠電泳,然后進(jìn)行成像分析。而熒光定量PCR可以在反應(yīng)進(jìn)行過程中進(jìn)行累積擴(kuò)增產(chǎn)物的分析和檢測,即“實(shí)時”。在反應(yīng)體系中加入熒光分子,通過熒光信號的按比例增加來反應(yīng)DNA量的增加,使PCR產(chǎn)物的實(shí)時檢測成為可能。在反應(yīng)體系中加入熒光分子,通過熒光信號的按比例增加來反應(yīng)DNA量的增加,使PCR產(chǎn)物的實(shí)時檢測成為可能。滿足實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡臒晒饣瘜W(xué)物質(zhì)包括DNA結(jié)合染料和熒光標(biāo)記的序列特異引物或探針;專門的熱循環(huán)儀配備熒光檢測模塊,用于監(jiān)測擴(kuò)增時的熒光,檢測到的熒光信號反映了每個循環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物的量。


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相對常規(guī)PCR而言,熒光定量PCR的主要優(yōu)點(diǎn)是準(zhǔn)確地確定初始模板拷貝數(shù)和寬的動態(tài)范圍內(nèi)和高的靈敏度。熒光定量PCR結(jié)果可以用于定性(判斷一段序列的有無),也可以用于定量(確定DNA拷貝數(shù)),即qPCR,而常規(guī)PCR只能做半定量。如采用常規(guī)的終點(diǎn)檢測法(利用EB染色來判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的多少,從而間接的判斷起始拷貝量),即使起始模板量相同經(jīng)PCR擴(kuò)增、EB染色后也完全有可能得到不同的終點(diǎn)熒光信號強(qiáng)度。另外,熒光定量PCR的結(jié)果無需通過瓊脂糖凝膠電泳來評估,大大節(jié)省實(shí)驗(yàn)時間,提高實(shí)驗(yàn)效率。還有,由于PCR反應(yīng)和檢測都在反應(yīng)管中進(jìn)行,樣品污染的幾率大大降低,無需擴(kuò)增后的實(shí)驗(yàn)操作。

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簡單的講PCR技術(shù)早是用于擴(kuò)增一段特異的PCR片段,用于克i隆、測序等實(shí)驗(yàn),后來也將其用于樣本中特異的PCR片段有無或相對定量,而熒光定量PCR技術(shù)則是為了測定樣本中特異的PCR片段相對或絕i對量,是一種測定特異的PCR片段含量的方式。如測定病i人樣本中病原體的含量、實(shí)驗(yàn)樣本中某一特定的mRNA的含量等。熒光定量PCR結(jié)果可以用于定性(判斷一段序列的有無),也可以用于定量(確定DNA拷貝數(shù)),即qPCR,而常規(guī)PCR只能做半定量。有人講過普通PCR后,通過電泳也可以進(jìn)行定量,其實(shí)是將PCR產(chǎn)物的定量與PCR樣本中模板定量相混了。


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FQ-PCR在醫(yī)學(xué)栓測中有價值的應(yīng)用領(lǐng)城就是對感i染性疾病的診斷,只要有限的核酸序列清楚,運(yùn)用FQ-PCR技術(shù),檢測任何病原體。目前,對一些培養(yǎng)周期長或缺乏穩(wěn)定可靠的檢測手段的病原體,可以考慮用FQ-PCR檢測,為臨床診斷提供依據(jù)FQ-PCR對病原體的檢測克服了免i疫學(xué)檢測的“窗口期“問題,可判斷疾病是否隱性或亞臨床狀態(tài)。廣州勱博--屠宰場熒光定量PCR擴(kuò)增序列特異性檢測方法是在PCR反應(yīng)中利用標(biāo)記熒光染料的基因特異寡核苷酸探針來檢測產(chǎn)物,它又可分為直接法和間接法。FQ-PCR技術(shù)可以應(yīng)用于腫癟的研究及診斷。

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實(shí)時熒光定量PCR的基本原理:理論上,PCR過程是按照2n(n代表PCR循環(huán)的次數(shù))指數(shù)的方式進(jìn)行模板的擴(kuò)增。但在實(shí)際的PCR反應(yīng)過程中,隨著反應(yīng)的進(jìn)行由于體系中各成分的消耗(主要是由于聚合酶活力的衰減)使得靶序列并非按指數(shù)方式擴(kuò)增,而是按線性的方式增長進(jìn)入平臺期。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,因此只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計(jì)算出該樣品的起始拷貝數(shù)。因此在起始模板量與終點(diǎn)的熒光信號強(qiáng)度間沒有可靠的相關(guān)性。如采用常規(guī)的終點(diǎn)檢測法(利用EB染色來判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的多少,從而間接的判斷起始拷貝量),即使起始模板量相同經(jīng)PCR擴(kuò)增、EB染色后也完全有可能得到不同的終點(diǎn)熒光信號強(qiáng)度。



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