雨水被收集后，要進行一定的處理，其水質(zhì)應達到《城市污水再生利用城市雜用水水質(zhì)》、《城市污水再生昨用景觀環(huán)境用水水質(zhì)》、《地表水環(huán)境質(zhì)量標準》等國家相關(guān)標準的要求，才能應用。根據(jù)用途確定雨水處理應該達到的水質(zhì)。屋面雨水收集系統(tǒng)應獨立設(shè)置，不得與室內(nèi)污廢水系統(tǒng)連接。如陽臺排出的廢水（如洗衣廢水）不能進入雨水立管。立管的底部應設(shè)檢查口。

 一般雨水在收集處理之前，需要進行初期棄流。對于初期棄流的雨水將其排放回到下游市政雨水管網(wǎng)。目前，利用植被淺溝，植被緩沖帶來截流凈化雨水徑流污染物的方法得到越來越多的應用。它不僅投資小，而且是一種便于管理和實施的凈化雨水方法。雨水的收集再利用要滿足相應的雜用水水質(zhì)要求，因此，雨水水質(zhì)的好壞將直接決定雨水收集利用的難易情況。雨水徑流流污染屬于非點源污染，具有突發(fā)性和非連續(xù)性。

水及生態(tài)環(huán)境修復功能，強化雨水入滲，以增加土壤的含水量，甚至利用雨水回灌提升地下水的水位，可改善水環(huán)境乃至生態(tài)環(huán)境，總之，城市雨水利用是解決城市水資源短缺，減少城市洪災的有效途徑。經(jīng)過初期棄流后收集的雨水，還要考慮到初雨之后，承雨面積內(nèi)仍然存在著的可能帶來污染以及偶然突發(fā)事件可能帶來的嚴重污染，故可以選擇采取隔油池、斜板沉淀池、砂濾池等幾種手段進行綜合處理。

利用滲透原理，將雨水通過滲透池，滲透管，滲透井，透水性鋪蓋，滲透側(cè)溝，調(diào)節(jié)池和綠地等滲透設(shè)施補充地下水，能有效緩解水資源短缺問題，此外，收集的雨水也可以經(jīng)消毒處理后供居民飲用。雨水字為經(jīng)妥善處理前，建議用于替代不與人體接觸的用水，將收集下來的雨水經(jīng)簡單處理和儲存后，用水泵提升至樓頂?shù)乃?，供沖洗廁所使用，雨水還可作為其他用水。