在發(fā)酵物料的后處理方面，大多數(shù)企業(yè)加入功能菌進(jìn)行復(fù)配、定形，產(chǎn)品劑型以粉塵為主，但也有采用滾筒造?；驍D壓造粒的。顆粒產(chǎn)品克服了粉的劑產(chǎn)品外觀差、層次低的缺點(diǎn)，提高了產(chǎn)品的商品性，但同時也提高了企業(yè)的生產(chǎn)成本，并對有效菌的存活產(chǎn)生了一定影響。 由于生物有機(jī)肥相比普通有機(jī)肥生產(chǎn)成本較高，主要應(yīng)用在蔬菜、水果、中草藥等高附加值的經(jīng)濟(jì)作物上，并取得了較好的效果。

微生物菌肥還要看活菌數(shù)量是否符合國家規(guī)定，國家規(guī)定生物菌劑有效活菌數(shù)≥2億/克，顆粒狀的≥1億/克，符合生物肥料和生物有機(jī)肥的有效活菌數(shù)≥2000萬/克。切記不合格的生物菌肥不要購買使用。生物菌肥與經(jīng)過充分腐熟的有機(jī)肥混合使用，其效果要遠(yuǎn)好于單獨(dú)施用有機(jī)肥和生物菌肥。生物菌肥避免開袋后長期不用，要注意密封儲存以免菌的種流失。開袋后長期不用，其他細(xì)菌就可能侵入袋內(nèi)，使肥料中的微生物菌群的發(fā)生改變，影響其使用效果。

基于目前化肥使用和農(nóng)業(yè)廢棄物現(xiàn)狀， 積極尋求環(huán)保的化肥替代品， 積極探索農(nóng)業(yè)廢棄物資源化利用的方式，已成為國內(nèi)外農(nóng)業(yè)研究的熱點(diǎn)。在此背景下， 生物有機(jī)肥以其獨(dú)特的優(yōu)勢為農(nóng)業(yè)廢棄物和作物生長搭建起一座橋梁，開辟出一條以“農(nóng)業(yè)廢棄物－生物有機(jī)肥－作物”為循環(huán)模式的可持續(xù)發(fā)展道路。施用生物有機(jī)肥是提高土壤基礎(chǔ)地力、改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)的重要途徑。生物有機(jī)肥研制和生產(chǎn)的初衷是集有機(jī)肥料和生物肥料優(yōu)點(diǎn)于一體， 既有助于提高作物產(chǎn)量，又能培肥土壤、調(diào)控土壤微生態(tài)平衡、減少無機(jī)肥料用量， 從根本上改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)， 符合中國農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和綠色農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)的方向。

生產(chǎn)生物有機(jī)肥是農(nóng)業(yè)廢棄物資源化利用的重要手段。農(nóng)業(yè)廢棄物中含有豐富的作物生長必需的營養(yǎng)元素和有機(jī)養(yǎng)分， 將其資源化利用制成生物有機(jī)肥，通過微生物的作用使有機(jī)物礦質(zhì)化、腐殖化和無害化，以供作物吸收利用，不僅可以緩解農(nóng)業(yè)廢棄物對環(huán)境的壓力，也可以變廢為寶，獲得一定的經(jīng)濟(jì)效益。

生物有機(jī)肥作為一種無污染環(huán)保型產(chǎn)品，是農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的必然選擇。