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脊索動物包括尾索動物、頭索動物和脊椎動物。除以上主要特征外,脊索動物還具有一些次要特征:密閉式循環(huán)系統(tǒng)(尾索動物除外),心臟如存在,總位于消化管的腹面;肛后尾,即位于后方的尾,存在于生活史的某一階段或終生存在
咽部兩側(cè)一系列左右成對排列的裂縫,直接或間接與外界相通。低等脊索動物及魚類的鰓裂終生存在,其他脊椎動物僅在胚胎期有鰓裂。來源于外胚層和內(nèi)胚層
脊索外圍有脊索鞘膜,并與背神經(jīng)管的外膜、肌節(jié)之間的肌隔、皮下結(jié)締組織等連續(xù)。脊索細(xì)胞呈扁盤狀,其超顯微結(jié)構(gòu)與雙殼類軟體動物的肌細(xì)胞比較相似,收縮時可增加脊索的硬度。