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蛋白質(zhì)晶體板
物理環(huán)境是影響蛋白質(zhì)晶體形核的重要因素。文中回顧了各種物理環(huán)境如光、電場、超聲波、磁場、微重力、溫度、機械振動、異相形核界面對蛋白質(zhì)晶體形核的影響,并對各物理環(huán)境下蛋白質(zhì)晶體形核的可能機制進(jìn)行探討,展望了利用物理環(huán)境影響蛋白質(zhì)晶體形核的研究前景。
蛋白質(zhì)結(jié)晶學(xué)的不斷發(fā)展,使得蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的測定成為現(xiàn)實,為設(shè)計,蛋白質(zhì)工程,生物電子技術(shù)的發(fā)展奠定了基礎(chǔ).目前遇到的大問題在于如何培養(yǎng)適合于結(jié)構(gòu)分析的大尺寸單晶.近年來,來自包括蛋白質(zhì)晶體學(xué),生物物理學(xué),生物化學(xué)以及凝固科學(xué)的研究者都投入了大量的精力,研究的重點集中在蛋白質(zhì)晶體的形核和生長機制.本文定性考察了溶液流動對溶菌酶晶體生長速度的影響。
蛋白結(jié)晶板介紹
研究蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)的物理化學(xué)分支學(xué)科。蛋白質(zhì)分子是由上百或更多的α-氨基酸作為單體縮合而成的多肽(見肽)鏈構(gòu)成的。能構(gòu)成蛋白質(zhì)中多肽鏈的α-氨基酸總共有 20種L-氨基酸。
組成蛋白質(zhì)分子的α-氨基酸都是L-異構(gòu)體,其構(gòu)型見圖2。圖2每個氨基酸或其殘基中羧酸根α位上的碳原子 Cα直接與氫原子、氨基和側(cè)鏈R基相連。在L-異構(gòu)體中,從Cα向R 看 時,按順時針順序排列是H、NH幦和COO。存在于蛋白質(zhì)分子中的20種氨基酸各以其側(cè)鏈R基而相區(qū)別。
甘氨酸的R基為一個氫原子,而其他氨基酸的R基分別為脂肪側(cè)鏈、帶羥基的脂肪側(cè)鏈、帶芳香環(huán)的側(cè)鏈、堿性側(cè)鏈、帶羧酸基的側(cè)鏈、帶酰胺基的側(cè)鏈和含硫側(cè)鏈等。
決定多肽鏈構(gòu)象的每個Cα原子參與的Cα-N和Cα-C單鍵旋轉(zhuǎn)角φ和Ψ。φ和Ψ為180°時,給出完全伸展的構(gòu)象,當(dāng)φ和Ψ都為0°時,將使左方肽中的N-H與右方肽中的C=O互相接觸(圖6)。角φ和Ψ以Cα給出的順時針方向為正。多肽鏈中的N-H和C=O基團當(dāng)參與形成較強的氫鍵時,氫鍵N-H…O長度約為2.80埃,而N→H與N→O之間的交角不超過30°。
蛋白質(zhì)晶體板介紹
蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈中主鏈原子的局部空間排布即構(gòu)象,不涉及側(cè)鏈部分的構(gòu)象。1.肽鍵平面(或稱酰胺平面,等人對一些簡單的肽及氨基酸的酰胺等進(jìn)行了線衍射分析,從一個肽鍵的周圍來看,得知:(1)肽鍵中的C-N鍵長0.132nm,比相鄰的N-C單鍵(0.147nm)短,而較一般C=N雙鍵(0.128nm)長,可見,肽鍵中-C-N-鍵的性質(zhì)介于單、雙鍵之間,具有部分雙鍵的性質(zhì),因而不能旋轉(zhuǎn),這就將固定在一個平面之內(nèi)。