菌群中的地衣芽孢等有益微生物施入土壤層后快速繁育成優(yōu)點(diǎn)菌群，操縱化感營(yíng)養(yǎng)成分和資源，使重茬、根腐、猝倒、牙床流動(dòng)性、灰霉病等病原菌喪失生存環(huán)境和標(biāo)準(zhǔn)。綠色植物根莖體細(xì)胞植物細(xì)胞變厚、肝纖維化、木制化，轉(zhuǎn)化成角質(zhì)層兩層，產(chǎn)生牢固天然屏障，避免病原菌侵入。綠色植物群中有益微生物如地衣芽孢、極大芽孢和側(cè)孢芽孢能夠提高土壤層緩存能力，維持水份和水份，提高農(nóng)作物的耐旱、耐寒和耐澇能力。與此同時(shí)，側(cè)生胞子的胞子鏈球菌也可以加強(qiáng)葉子防護(hù)膜，抵御病原菌的感柒，抵御病害。

微生物肥料的種類(lèi)很混亂，許多種植者無(wú)法分辨它們是微生物制劑還是細(xì)菌肥料。微生物菌劑和菌肥的區(qū)別主要在于產(chǎn)品中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和有機(jī)物質(zhì)的含量。有必要結(jié)合實(shí)際需要選擇合適的產(chǎn)品。人們認(rèn)為產(chǎn)品中細(xì)菌的種類(lèi)和數(shù)量越多，產(chǎn)品越好。這也是錯(cuò)誤的。復(fù)合菌劑的效果受不同軍種生長(zhǎng)習(xí)性的影響。盲用化合物容易引起君種間的拮抗，影響應(yīng)用效果。請(qǐng)注意，只有活菌在產(chǎn)品中真正發(fā)揮作用，所以活菌越有效，效果越好。物種的純度也非常重要。當(dāng)產(chǎn)品中霉菌和細(xì)菌的數(shù)量和比率超過(guò)標(biāo)準(zhǔn)時(shí)，使用效果也會(huì)受到影響。

協(xié)助作物消化吸收營(yíng)養(yǎng)物質(zhì):比如，根瘤菌能夠刺激性豆科植物植物的根產(chǎn)生腐病，使土壤中的氮能夠轉(zhuǎn)變成為作物能夠吸取的基肥。 提高植物抗病力(蟲(chóng)類(lèi)抵抗性):生物微生物中藥制劑中的微生物能夠在土壤中代謝素su、化肥和植物細(xì)胞生長(zhǎng)因子。素su和滅蟲(chóng)劑能夠殺掉植物病害的卵。植物細(xì)胞生長(zhǎng)因子推動(dòng)光合強(qiáng)度的提升，提升植物的呼吸作用工作能力。除此之外，它還能推動(dòng)植物造成很多乳酸脫氫酶、超氧化物歧化酶、酶等酶，進(jìn)而維持細(xì)胞質(zhì)的可靠性，提升植物防御力。 提高植物的抗逆性:在使用一些生物微生物劑后，他們?cè)谕寥乐泻芏嗌L(zhǎng)繁育，并集聚在作物根處產(chǎn)生優(yōu)點(diǎn)有益菌，在本身生長(zhǎng)發(fā)育歷程的并且還可以改進(jìn)周邊環(huán)境和植物的抗逆性。