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PCR實(shí)驗(yàn)室的相關(guān)設(shè)置
要完成一組PCR實(shí)驗(yàn),通常需要經(jīng)過(guò)試劑配制、樣品處理、核酸擴(kuò)增和產(chǎn)物分析4個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程。
這4個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程的實(shí)驗(yàn)用房應(yīng)相鄰布置,組成一個(gè)獨(dú)立的PCR實(shí)驗(yàn)區(qū)。標(biāo)準(zhǔn)的PCR實(shí)驗(yàn)區(qū)包括:試劑準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)、各區(qū)配套的緩沖區(qū)及公共走廊。
PCR實(shí)驗(yàn)室整體平面布局某醫(yī)院PCR實(shí)驗(yàn)室平面布局如圖1所示,整個(gè)區(qū)域有一個(gè)公用走廊,每個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)區(qū)設(shè)有專(zhuān)門(mén)的緩沖區(qū)。通過(guò)壓差控制,使整個(gè)PCR實(shí)驗(yàn)過(guò)程中試劑和標(biāo)本免受氣溶膠的污染,并且降低擴(kuò)增產(chǎn)物對(duì)人員和環(huán)境的污染。
試劑準(zhǔn)備區(qū)該實(shí)驗(yàn)區(qū)主要進(jìn)行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備。
試劑和用于標(biāo)本制作的材料應(yīng)直接運(yùn)送至該區(qū),不得經(jīng)過(guò)其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。
試劑準(zhǔn)備區(qū)配備有2~8°C冰箱和-80°C冰箱,計(jì)算冷負(fù)荷時(shí),需要將它們計(jì)算在內(nèi)。
房間的面積宜控制在15m2~20m2。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對(duì)正壓狀態(tài),以防止外界含核酸氣溶膠的空氣進(jìn)入,造成污染。
標(biāo)本制備區(qū)該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為臨床標(biāo)本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴(kuò)增反應(yīng)管和測(cè)定RNA時(shí)cDNA的合成。
標(biāo)本制備區(qū)配備有2~8°C冰箱和-20°C冰箱,計(jì)算冷負(fù)荷時(shí),需要將它們計(jì)算在內(nèi)。在標(biāo)本制備區(qū),還需要配備生物安全柜,用于進(jìn)行提取核酸的操作。
PCR實(shí)驗(yàn)室建設(shè)PCR實(shí)驗(yàn)室如何分區(qū)?應(yīng)該分3區(qū)還是4區(qū)呢?
標(biāo)準(zhǔn)的PCR實(shí)驗(yàn)室可分成4個(gè)區(qū)域,按操作流程包括:
1)
試劑準(zhǔn)備區(qū):擴(kuò)增試劑的配制、分裝、保存。
2)
樣本制備區(qū):樣本分裝,核酸提取、保存。
3)
核酸擴(kuò)增區(qū):提取純化的核酸上機(jī)擴(kuò)增。
4)
產(chǎn)物分析區(qū):擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)果分析,生成報(bào)告。
隨著核酸檢測(cè)方法的優(yōu)化和實(shí)驗(yàn)儀器的功能強(qiáng)化,PCR實(shí)驗(yàn)走向了自動(dòng)化和高通量,這大大降低了病毒檢測(cè)的時(shí)間、提高了檢測(cè)的效率,也改變了普通PCR實(shí)驗(yàn)室建設(shè)的平面布局。如全自動(dòng)定量PCR實(shí)驗(yàn)室可設(shè)置為試劑制備區(qū)、樣本處理區(qū)、核酸擴(kuò)增和產(chǎn)物分析區(qū),后兩個(gè)區(qū)合并(用于新冠病毒檢測(cè)的PCR實(shí)驗(yàn)室)。一體化自動(dòng)化PCR實(shí)驗(yàn)室設(shè)置試劑制備和自動(dòng)檢測(cè)區(qū),后三個(gè)區(qū)合并