在發(fā)酵物料的后處理方面，大多數(shù)企業(yè)加入功能菌進行復配、定形，產(chǎn)品劑型以粉塵為主，但也有采用滾筒造?；驍D壓造粒的。顆粒產(chǎn)品克服了粉的劑產(chǎn)品外觀差、層次低的缺點，提高了產(chǎn)品的商品性，但同時也提高了企業(yè)的生產(chǎn)成本，并對有效菌的存活產(chǎn)生了一定影響。 由于生物有機肥相比普通有機肥生產(chǎn)成本較高，主要應用在蔬菜、水果、中草藥等高附加值的經(jīng)濟作物上，并取得了較好的效果。

微生物菌肥不宜與殺菌劑、殺蟲劑、除草的劑同時使用，也不要在使用生物菌肥后再實行土壤消毒。生物菌肥適宜的土壤濕度為60%左右，所以要注意不要在過分干旱時使用。生物菌肥對于陽光中的紫外線敏感，不宜采用地表撒施，可以在陰天或清晨、傍晚于土壤中施用。生物菌肥施入土壤后，有一個菌群繁殖壯大的過程，因此，在果樹根系開始生長前使用。

基于目前化肥使用和農(nóng)業(yè)廢棄物現(xiàn)狀， 積極尋求環(huán)保的化肥替代品， 積極探索農(nóng)業(yè)廢棄物資源化利用的方式，已成為國內(nèi)外農(nóng)業(yè)研究的熱點。在此背景下， 生物有機肥以其獨特的優(yōu)勢為農(nóng)業(yè)廢棄物和作物生長搭建起一座橋梁，開辟出一條以“農(nóng)業(yè)廢棄物－生物有機肥－作物”為循環(huán)模式的可持續(xù)發(fā)展道路。施用生物有機肥是提高土壤基礎地力、改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)的重要途徑。生物有機肥研制和生產(chǎn)的初衷是集有機肥料和生物肥料優(yōu)點于一體， 既有助于提高作物產(chǎn)量，又能培肥土壤、調(diào)控土壤微生態(tài)平衡、減少無機肥料用量， 從根本上改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)， 符合中國農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和綠色農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)的方向。

具下列任何一條款者，均為合格產(chǎn)品

     a. 產(chǎn)品全部技術指標都符合標準要求；      b. 在產(chǎn)品的外觀、pH值、水分檢測項目中，有1項不符合標準要求，而產(chǎn)品其它各項指標符合標準要求。

    具下列任何一條款者，均為不合格產(chǎn)品

     a. 產(chǎn)品中有效活菌數(shù)不符合標準要求；

     b.有機質(zhì)含量不符合標準要求；

     c. 糞大腸菌群數(shù)不符合標準要求；

     d. 蛔蟲卵死率不符合標準要求；

     e. As、Cd、Pb、Cr、Hg中任一含量不符合標準要求；

     f.產(chǎn)品的外觀、pH值、水分檢測項目中，有2項以上不符合標準要求。