根據(jù)限制酶的結(jié)構(gòu)，輔因子的需求切位與作用方式，可將限制酶分為三種類型，分別是第yi型（Type I）、第二型（Type II）及第三型（Type III）?！　?/p>

第yi型限制酶同時具有修飾(modification)及認(rèn)知切割(restriction)的作用；另有認(rèn)知(recognize)DNA上特定堿基序列的能力，內(nèi)切酶，通常其切割位(cleavage site)距離認(rèn)知位(recognition)可達(dá)數(shù)千個堿基之遠(yuǎn)。例如：EcoB、EcoK。　　

第二型限制酶只具有認(rèn)知切割的作用，修飾作用由其他酵素進(jìn)行。所認(rèn)知的位置多為短的回文序列(palindrome sequence)；所剪切的堿基序列通常即為所認(rèn)知的序列。是遺傳工程上，實(shí)用性較高的限制酶種類。例如：EcoRI、HindIII?！　?/p>

第三型限制酶與第yi型限制酶類似，同時具有修飾及認(rèn)知切割的作用?？烧J(rèn)知短的不對稱序列，切割位與認(rèn)知序列約距24-26個堿基對。例如：EcoPI、HinfIII。

限制性酶切分析法

限制性酶切分析法是指基因組或一段核酸用限制性內(nèi)切酶消化產(chǎn)生的片段經(jīng)電泳等方法分離形成特別的條帶圖譜，對DNA序列的特征進(jìn)行的分析。限制性酶是生物體內(nèi)能識別并切割特異的雙鏈DNA序列的一種內(nèi)切核酸酶。它是可以將外來的DNA切斷的酶，即能夠限制異源DNA的侵入并使之失去活力，但對自己的DNA卻無損害作用。

限制酶是基因工程中所用的重要切割工具?？茖W(xué)家已從原核生物中分離出了許多種限制酶，并且已經(jīng)商品化，在基因工程中廣泛使用。根據(jù)限制酶切割的特點(diǎn)，可將它們分為兩大類：一類是切割部位無特異性的；另一類是可特異性地識別核苷酸序列，即只能在一定的DNA序列上進(jìn)行切割。

一般是以微生物屬名的第yi個字母和種名的前兩個字母組成，第四個字母表示菌株（品系）。例如，從Bacillus amylolique faciens H中提取的限制性內(nèi)切酶稱為Bam H，在同一品系細(xì)菌中得到的識別不同堿基順序的幾種不同特異性的酶，可以編成不同的號，如HindⅡ、HindⅢ，HpaI、HpaⅡ，MboI、MboⅡ等。

別名：restriction endonuclease簡稱限制酶

酶反應(yīng)：限制性內(nèi)切酶能分裂DNA分子在一限定數(shù)目的專一部位上。它能識別外源DNA并將其降解。

單位定義：在指明pH與37℃，在0.05mL反應(yīng)混合物中，1小時消化1μg的λDNA的酶量為1單位。

性狀制品不含非專一的核酸水解酶（由10單位內(nèi)切酶與1μg λDNA，保溫16小時所得的凝膠電泳圖譜的穩(wěn)定性表示），這類酶主要是從原核生物中分離出來的，迄今已經(jīng)從近300多種不同的微生物中分離出約4000種限制酶。

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