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蛋白分布在細胞中的各個位置,其中蛋白豐度高,種類豐富的研究比較深入。定位注釋結果準確的區(qū)域有細胞核,原生質(zhì)體,線粒體,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等,植物還有葉綠體和液泡。注意:1、不建議將爬片泡酸后高壓滅菌,首先玻片太薄高壓容易使玻片變形,其次濕滅很容易使玻片上留下水漬影響細胞貼壁。而對于定位在細胞膜,分泌蛋白或者定位在多個區(qū)域的蛋白來說,其亞細胞定位預測信息一般準確性較低。
通過對目的蛋白的標記,例如融合綠色熒光蛋白GFP,使用掃描共聚焦顯微鏡激發(fā)熒光,從而對蛋白的表達分布予以確認。依據(jù)對亞細胞分布的準確度不同,亞細胞定位的實驗設計也分成簡化型亞細胞定位分析和內(nèi)參型共定位分析。以單細胞RNA-seq技術為基礎的轉(zhuǎn)錄組學分析技術的革命性提升,實現(xiàn)了單細胞內(nèi)部數(shù)以千萬個轉(zhuǎn)錄本的同時檢測,完整地勾勒出各細胞活動之間的動態(tài)關聯(lián)。對于植物蛋白的亞細胞定位分析,主要通過構建融合熒光蛋白的過表達質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化煙1草和原生質(zhì)體瞬時表達體系確定其定位及共定位情況。
原理:構建編碼目bai標蛋白和熒光蛋du白的融合蛋白的載體,轉(zhuǎn)染細胞,表zhi達,然后激光共聚焦顯微鏡dao觀察熒光信號所在位置,即可知道該蛋白的亞細胞定位。注意做空載熒光蛋白的對照。
具體步驟:構建目標蛋白與GFP的融合蛋白的瞬時表達載體,基因槍轟擊洋蔥內(nèi)表皮細胞,或化學(PEG)轉(zhuǎn)化原生質(zhì)體,瞬時表達后用熒光顯微鏡觀察熒光位置,當然激光共聚焦圖片會更漂亮。